Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMBP08118 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMBP08118 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSMBP08118 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSMBP08118 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSMBP08118 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms