Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPBP07199 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPBP07199 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPBP07199 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPBP07199 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPBP07199 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPBP07199 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPBP07199 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms