Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms