Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIC3O95833 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms