Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG13O75143 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG13O75143 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG13O75143 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms