Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CYTIPO60759 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CYTIPO60759 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CYTIPO60759 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CYTIPO60759 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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