Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AIREO43918 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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AIREO43918 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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AIREO43918 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AIREO43918 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AIREO43918 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms