Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms