Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRY3O43610 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRY3O43610 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms