Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms