Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms