Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNMO15061 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNMO15061 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNMO15061 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNMO15061 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNMO15061 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNMO15061 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNMO15061 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNMO15061 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNMO15061 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms