Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms