Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf98E9PRG8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms