Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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