Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms