Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP69A5D8W1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms