Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMB4A4D0S4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms