Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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