Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms