Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms