Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHDC2Q9Y2U9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms