Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPH3AQ9Y2J0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms