Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms