Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF8Q9UPP1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms