Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC9Q9UKV0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms