Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PACSIN3Q9UKS6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN3Q9UKS6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms