Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms