Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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