Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms