Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms