Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms