Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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