Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A1Q9NY26 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms