Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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