Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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