Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TDP1Q9NUW8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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TDP1Q9NUW8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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TDP1Q9NUW8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDP1Q9NUW8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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