Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms