Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRT82Q9NSB4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms