Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASS4Q9NQ75 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms