Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VCX3AQ9NNX9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms