Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00597Q9H2U6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms