Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NYXQ9GZU5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms