Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BPESC1Q9GZL8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BPESC1Q9GZL8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms