Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTMR12Q9C0I1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms