Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms