Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms