Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3R4Q99570 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms