Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLIN4Q96Q06 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLIN4Q96Q06 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms