Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFXN2Q96NB2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms